メカゴジラの残骸を調査していた潜水艇・あかつきが未知の恐竜に襲われた。それは１５年前に学会を追放された、真船信三博士によって操られるチタノザウルスだった。博士のコントロールシステムに目をつけたブラックホール第三惑星人は、実験中に死んだ博士の娘・桂をサイボーグ手術によって甦らせ、その代償としてメカゴジラの修復作業を真船博士に行わせていたのだ……。『ゴジラ対メカゴジラ』の続編。（allcinema）