キングギドラとの死闘の後、海中に没していたゴジラが大隕石墜落の衝撃によって目覚めた。一方、南海のインファント島でも異変が衛星写真で確認されていた。島に赴いたトレジャーハンターの藤戸と別れた妻・雅子、丸友商事の安藤の３人は、そこで巨大な卵と妖精コスモスと遭遇、環境破壊のため“地球生命”に滅ぼされてしまったコスモスたちの歴史と、コスモスたちの守護神モスラ、そして再び“地球生命”を守るために復活するバトラの存在を知る……。（allcinema）