後のＳＦ界に多大な影響を与えた士郎正宗の傑作漫画『攻殻機動隊』が発表されて25周年になるのを記念して製作された完全新作による長編アニメーション。“攻殻機動隊”の誕生の物語と草薙素子の出生の秘密が描かれていく。情報ネットワークと義体技術の発達により、人々の脳がネットワークと接続され、ほとんどの人間が電脳化された近未来。2029年3月。総理大臣が何者かが仕掛けた爆発物によって暗殺される事件が発生する。被害者の中には、草薙素子のかつての上司、501機関のクルツもいた。さっそく草薙は、バトーやトグサらはぐれ者の寄せ集め集団を率いて捜査を開始する。やがて、その過程で掴んだ手がかりが、草薙の秘められた生い立ちへも繋がっていくのだったが…。（allcinema）