リトル家の一員として平穏な毎日を送るスチュアート。兄ジョージと共に通う学校での生活をそれなりにエンジョイしているスチュアートだったが、家では両親が新しい家族である妹マーサにかかりきりで、少し寂しさを感じていた。そんなある日、学校からの帰り道、スチュアートは、傷ついて空から落ちてきた小鳥のマーガロと出会い、マンハッタン中の動物たちを恐怖に陥れる恐ろしい悪の権化ファルコンから、勇敢にも彼女を助け出す。マーガロをリトル家に連れ帰り介抱していたスチュアートは、今までに感じたことのないような不思議な感情を抱き始めるのだった……。（allcinema）